Los servicios navieros son un componente esencial de la cadena logística portuaria y comprenden tanto a las compañías navieras como a los agentes de naves. Las compañías navieras desempeñan un papel crucial en el transporte marítimo de cargas y pasajeros, proporcionando el principal medio de transporte para el comercio exterior de Chile y el mundo. Por otro lado, los agentes de naves son representantes de las embarcaciones y asumen la responsabilidad de todos los procesos relacionados con la atención y el atraque de los buques en el puerto.
Actualmente, las compañías navieras que operan en Puerto Valparaíso y que forman parte de FOLOVAP son Mediterranean Shipping Company (MSC), Maersk, Hapag-Lloyd y Cool Carriers. Asimismo, las agencias de nave que participan son Ultramar y Ian Taylor.
