La participación de las universidades en las Comunidades Logísticas Portuarias es de gran valor para la consolidación de estos organismos, aunque no participen directamente en los procesos portuarios de la cadena logística.
Las universidades y centros de formación permiten vincular a las cadenas logísticas con la ciudad y el medio, son generadores de la fuerza laboral de la industria, y aportan en los procesos de innovación, investigación e implementación de nuevas tecnologías.
En el caso de FOLOVAP, las universidades que participan son la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso (PUCV) y Universidad de Valparaíso (UV).